Ο ιός μεταλλάχθηκε: Εδώ γιατί ανακάλυψε τα Αγγλικά πριν από άλλους

Οι Βρετανοί ήταν οι πρώτοι που προειδοποίησαν για την εμφάνιση ενός νέου, πιθανώς πιο μεταδοτικού τύπου ιού. Όπως επισημαίνει ο Olivier Ferrand, είναι πολύ πιθανό αυτή η μετάλλαξη να έχει ήδη εξαπλωθεί, είτε στη Γαλλία είτε αλλού στην Ευρώπη. Εάν η Ιταλία το έχει ήδη ανακαλύψει στην επικράτειά της, τότε αυτό δεν συμβαίνει ακόμη στη Γαλλία. Μια κατάσταση που εκπλήσσει αναγκαστικά επειδή η ικανότητα της πολιτείας να αναγνωρίζει νέες παραλλαγές εξαρτάται άμεσα από τη ρύθμισή της σε σχέση με την ακολουθία του γονιδιώματος του ιού, δηλαδή την ικανότητά της να προσδιορίζει με ακρίβεια την «ταυτότητα» του ιού. Για να βρείτε, όχι εκπληκτικά, πρέπει να κοιτάξετε. Σε αυτό το σημείο, η Μεγάλη Βρετανία φαίνεται καλύτερα εξοπλισμένη.

Η εναλλακτική που ανησυχεί σήμερα οι ερευνητές θα είχε εμφανιστεί πριν από αρκετές εβδομάδες. Ένα στοιχείο που τράβηξε την προσοχή του χρήστη του Διαδικτύου και του επιστήμονα δεδομένων από το επάγγελμα, ο οποίος εξέφρασε στο Twitter την έκπληξή του για το γεγονός ότι μια τέτοια έκρηξη δεν είχε ακόμη εντοπιστεί στη Γαλλία. Αφού έκανε κάποια έρευνα, παρατήρησε ότι οι Βρετανοί γείτονές μας πραγματοποιούν πάρα πολλές γενετικές αλληλουχίες για το SARS-CoV-2. “100 φορές περισσότερο από τη Γαλλία”, Αυτος λεει. Αυτή η παρατήρηση υποστηρίζεται από γραφικά διαθέσιμα στο GISAID, μια πλατφόρμα αναφοράς όπου κοινοποιούνται δεδομένα από εργαστήρια που μελετούν το γονιδίωμα.

Η Γαλλία υστερεί στη σειρά; Όχι απαραίτητα, αλλά η Μεγάλη Βρετανία έχει προφανώς πολλά βήματα προς τα εμπρός σε αυτόν τον τομέα, επιβεβαιώνοντας την Etienne Simon Laurier, επικεφαλής του Εργαστηρίου Εξελικτικής Γονιδιωματικής για ιούς RNA στο Ινστιτούτο Pasteur. Όταν ρωτήθηκε από τον LCI, το σκέφτηκε “Άλλες χώρες θα είχαν καταλήξει να ανακαλύπτουν αυτήν την εναλλακτική λύση.”Αλλά οι Βρετανοί, είναι, “Μάθετε σε σχεδόν πραγματικό χρόνο. Έχουν ένα πραγματικά καταπληκτικό σύστημα παρακολούθησης.”

πρακτικά, “Είναι οι μόνοι στον κόσμο σήμερα που ακολουθούν αυτόν τον γρήγορο και συντονισμένο τρόπο σε όλη την επικράτειά τους. Αποφάσισαν αρκετά νωρίς για να δημιουργήσουν μια ομοσπονδία και να διαδώσουν την οργάνωσή τους σε μια κλίμακα – Βρετάνη. Υπάρχουν πολύ λίγες χώρες που κατάφεραν να κάνουν το ίδιο.” Ένα αποδεδειγμένο σύστημα που εντυπωσιάζει τον ερευνητή: “Το ωραίο είναι ότι όλα είναι κεντρικά. Πολλά εργαστήρια το κάνουν σειριοποιημένο χρησιμοποιώντας τις δικές τους μεθόδους και στη συνέχεια μοιράζονται όλα τα δεδομένα. Συλλέχθηκαν και αναλύθηκαν μαζί σχεδόν την κατάλληλη στιγμή. Πραγματικό. Είναι πραγματικά τεράστιο.” Ως εκ τούτου, αυτή η διαφορά (από 1 έως 100) εφαρμόστηκε στο μέγεθος της ακολουθίας.

“στη Γαλλία”Η Etienne Simon Laurier συνεχίζει, «Αυθόρμητα και ανεξάρτητα προγράμματα» Υφιστάμενο «Ταυτόχρονα, τα NRC, ειδικά στο Παρίσι, συγκρούστηκαν και μοιράστηκαν δεδομένα σε πραγματικό χρόνο από την αρχή, αλλά δεν λαμβάνουν ένα τεράστιο κλάσμα του αριθμού των περιπτώσεων. Δεν θα ήταν απαραιτήτως υπερβολικά αντιπροσωπευτικό. Λίγες ακόμη εβδομάδες για να δούμε αν η εναλλακτική εξάπλωση στη Γαλλία ή όχι “.

Στο τρέχον πλαίσιο, αναγνωρίζουμε ότι η ταχεία αναγνώριση της μετάλλαξης είναι κάτι περισσότερο από ευεργετική για την αποτελεσματική προσαρμογή των μέτρων υγείας και την ανταπόκριση. Έτσι, το βρετανικό σύστημα μπορεί να χρησιμεύσει ως πρότυπο για το μέλλον. Ειδικά στη Γαλλία, φαίνεται ότι μπορεί να σημειωθεί πρόοδος στη συλλογή πληροφοριών. Ένας ειδικός του Ινστιτούτου Pasteur εξοικειωμένος με την πλατφόρμα GISAID σημειώνει μερικά ενδιαφέροντα στοιχεία. Παρατηρήστε ότι υπάρχει “Τακτικά βλέπει τα εργαστήρια να καταθέτουν όλες τις ακολουθίες τους ταυτόχρονα.”. Έτσι θυμάται το εργαστήριο που ιδρύθηκε στις αρχές της σχολικής χρονιάς “Όλα όσα πέτυχε μεταξύ Μαρτίου και Σεπτεμβρίου”. Εάν τα δεδομένα “Πολύ μοντέρνα είναι χρήσιμα, αλλά οι εφαρμογές που είναι αρκετών μηνών είναι πολύ λιγότερες.”, Ο αναζητητής γλιστρά.

Στο μέλλον, ο τρόπος εργασίας της αναζήτησης θα μπορούσε επίσης να εξελιχθεί, ιδίως όσον αφορά την κοινή χρήση δεδομένων. Σήμερα, αυτά δεν κοινοποιούνται απαραίτητα στην επιστημονική κοινότητα αυτόματα. Αυτό σημαίνει ότι στην πράξη, πολλές από τις ακολουθίες SARS-CoV-2 θα μπορούσαν να γίνουν στη Γαλλία χωρίς να τραβήξουν την προσοχή των ερευνητών-μελών σε άλλα εργαστήρια. Εάν αυτό θα μπορούσε να εξηγηθεί από τον έντονο ανταγωνισμό στον τομέα της έρευνας, πιθανότατα θα εμπόδιζε την κατανόηση του ιού και θα εμπόδιζε την ανάλυση της δυναμικής πίσω από την εξάπλωσή του. Το Βρετανικό Σύστημα, από το οποίο κέρδισε η Etienne Simon Laurier «Μεγάλη χρηματοδότηση»Τείνει να δείχνει ότι ένα σημαντικό δίκτυο αναμεμειγμένο με έναν συστηματικό συγκεντρωτισμό αποδεικνύεται ενάρετο, ειδικά κατά τη διάρκεια μιας κρίσης όπως αυτή που βρίσκεται σήμερα σε εξέλιξη στην Ευρώπη και τον κόσμο.